Franja marino-costera
Sistema Nacional de Áreas Protegidas
Océano o aguas profundas
Galápagos terrestre
Bosques secos y semiáridos
Páramos
Bosques húmedos del Chocó
Bosques montanos o nublados
Los manglares
En esta zona la sobrepesca también ha sido considerada la mayor amenaza, y la falta de leyes y monitoreo hace que ciertas especies hayan sido sobreexplotadas. El bacalao y la sardina se han reducido notablemente.El uso de ciertas herramientas a ocasiona impacto negativo en el ecosistema.
Deforestación para la apertura de caminos y la transformación de áreas de cultivo. Un gran número de especies silvestres se han visto amenazadas debido a que quedan aisladas en pequeños fragmentos de bosques.
La explotación no planificada de la madera para la industria; además, no se ha aplicado un plan de sostenibilidad, lo que puede llegar a agotar este recurso.
-Parque Nacional Galápagos -Reserva Marina de Galápagos -Parque Nacional Machalilla -Reserva Ecológica Manglares Churute -Reserva Ecológica Mache-Chindul -Reserva Ecológica Arenillas -Parque Nacional Sangay -Parque Nacional Yasuní
Una de las principales amenazas ha sido la construcción de piscinas para cultivo de camarón. Otros problemas son que se saca el agua de las piscinas sin ser tratada y las sustancias químicas afectan a especies sensibles.
La ganadería y la agricultura. El sobrepastoreo erosiona los suelos y los convierte en extensas zonas áridas que pierden la capacidad de retener el agua.
Se ha reemplazado estas regiones en zonas de grandes cultivos y pastos. Centenares de algarrobos son destruidos para hacerlos carbón para asaderos.
Las principales amenazas datan desde el tiempo de los balleneros, que utilizaron las islas para abastecerse de tortugas gigantes que permanecían largo tiempo en los barcos sin consumir alimento.
La sobrepesca y la contaminación ha puesto en riesgo la estabilidad de estos ecosistemas. La sobrepesca o extracción anual de millones de toneladas de pesca pone en riesgo a varias especies de peces de este ecosistema y es la industria pesquera la responsable de esta actividad.